Datenquellen und Formate in der Bioinformatik: Online-Quiz für Studierende

Question 1

Welche der folgenden Aussagen beschreibt die GenBank-Datenbank korrekt?

Accepted Answer

Sie wird vom National Center for Biotechnology Information (NCBI) verwaltet.

Answer

Sie enthält ausschließlich Sequenzdaten von Bakterien.

Answer

Ihre Nutzung ist kostenpflichtig.

Answer

Sie enthält keine annotierten Sequenzen.

Question 2

Welche Informationen liefert die UniProt-Datenbank über Proteinsequenzen in der Bioinformatik?

Accepted Answer

Umfassende Informationen, einschließlich Aminosäurezusammensetzung, Modifikationen und Anmerkungen zur Funktion

Answer

Nur begrenzte Informationen, hauptsächlich zur Annotation von DNA-Sequenzen

Answer

Keine Werkzeuge zur Analyse oder Interpretation von Proteinsequenzen

Answer

Rein theoretische Ressource ohne praktische Anwendung

Question 3

Wie wird GenBank für die Sequenzanalyse genutzt? Erläutere die Suche nach Sequenzen, den Abruf von Sequenzdaten und die Verwendung von Analysewerkzeugen.

Accepted Answer

GenBank speichert Sequenzdaten in FASTA- und XML-Formaten.

Answer

GenBank bietet nur eine begrenzte Anzahl von Sequenzdaten.

Answer

GenBank-Sequenzen sind nicht für phylogenetische Analysen geeignet.

Answer

Die BLAST-Suche ist in GenBank nicht verfügbar.

Question 4

Welche Datenbank enthält Informationen zu Proteinsequenzen?

Accepted Answer

UniProt

Answer

GenBank

Answer

PubMed

Answer

PDB

Question 5

Mit welchem Datenformat werden DNA-Sequenzen gespeichert?

Accepted Answer

FASTA

Answer

PDB

Answer

XML

Answer

JSON

Question 6

Mit welchem Tool sucht man in Datenbanken nach Sequenzen?

Accepted Answer

BLAST

Answer

ClustalW

Answer

MEGA

Answer

R

Question 7

Mit welchem Datenformat werden Proteinstrukturen gespeichert?

Accepted Answer

PDB

Answer

FASTA

Answer

XML

Answer

JSON

Question 8

Mit welchem Tool richtet man mehrere Sequenzen aus?

Accepted Answer

ClustalW

Answer

BLAST

Answer

MEGA

Answer

R

Question 9

Welche Datenbank enthält Informationen zur genomischen Varianz?

Accepted Answer

dbSNP

Answer

UniProt

Answer

PDB

Answer

GenBank

Question 10

Welche Datenbank ist die beste Quelle für detaillierte Informationen zu Proteinsequenzen und -strukturen?

Accepted Answer

UniProt

Answer

GenBank

Answer

PubMed

Answer

EMBL

Question 11

Welche Kriterien sind bei der Auswahl eines geeigneten Datenformats für die Speicherung und den Austausch genomischer Daten am wichtigsten?

Accepted Answer

Datengröße, Kompressionsrate, Zugriffsgeschwindigkeit

Answer

Dateityp, Speicherort, Dateigröße

Question 12

Welche Datenbank enthält Informationen zu Proteinsequenzen?

Accepted Answer

UniProt

Answer

Protein Data Bank (PDB)

Answer

PubMed

Answer

GenBank

Question 13

Welches Datenformat wird zur Speicherung von DNA-Sequenzen verwendet?

Accepted Answer

FASTA

Answer

JavaScript Object Notation (JSON)

Answer

Comma-Separated Values (CSV)

Answer

Extensible Markup Language (XML)

Question 14

Welche Aussage über GenBank ist korrekt?

Accepted Answer

Sie ist eine öffentlich zugängliche Datenbank für Genomsequenzen.

Answer

Sie wird von einer privaten Organisation verwaltet.

Answer

Sie enthält nur Sequenzen von Bakterien.

Answer

Sie ist eine Sammlung von wissenschaftlichen Artikeln.

Question 15

Was ist ein Vorteil der Verwendung von Bioinformatik-Datenbanken?

Accepted Answer

Ermöglicht den Vergleich von Sequenzen und die Identifizierung von Mustern.

Answer

Eliminiert die Notwendigkeit von Laborexperimenten.

Answer

Bietet eine Komplettlösung für alle biologischen Probleme.

Question 16

Welches Tool wird zur Suche nach Sequenzen in GenBank verwendet?

Accepted Answer

Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)

Answer

PubMed

Answer

Google

Answer

Excel

Question 17

Welche Methode wird verwendet, um die Ähnlichkeit zwischen zwei Sequenzen zu berechnen?

Accepted Answer

Sequenzausrichtung

Answer

Anomalieerkennung

Answer

Regression

Answer

Clusteranalyse

Question 18

Welches Datenformat eignet sich am besten zum Speichern von Proteindomänen?

Accepted Answer

Protein Families (PFAM)

Answer

Protein Data Bank (PDB)

Answer

FASTA

Question 19

Welche Aussage über Next-Generation Sequencing (NGS)-Daten ist korrekt?

Accepted Answer

Sie werden in großen Mengen produziert und erfordern spezialisierte Analysewerkzeuge.

Answer

Sie können nur für die Sequenzierung von RNA verwendet werden.

Answer

Sie sind immer genauer als Sanger-Sequenzierung.

Question 20

Was versteht man unter einem "Konsensussequenz"?

Accepted Answer

Eine Sequenz, die die am häufigsten vorkommenden Basen an jeder Position einer Gruppe verwandter Sequenzen darstellt.

Answer

Eine Sequenz, die die Referenzsequenz für eine bestimmte Spezies ist.

Question 21

Welche Software wird häufig für die Visualisierung von Genomdaten verwendet?

Accepted Answer

Integrative Genomics Viewer (IGV)

Answer

Adobe Photoshop

Answer

Microsoft Word

Answer

Excel

Question 22

Welche der folgenden Datenbanken gilt als zentraler Fundus für Proteinsequenzen?

Accepted Answer

UniProt

Answer

PDB

Answer

GenBank

Answer

PubMed

Question 23

Welches Format wird in der Bioinformatik üblicherweise zur Speicherung von DNA- und Aminosäuresequenzen verwendet?

Accepted Answer

FASTA

Answer

CSV

Answer

XML

Answer

JSON

Question 24

Welche der folgenden Aussagen beschreibt zutreffend die GenBank-Datenbank?

Accepted Answer

Sie enthält umfassende Informationen zu Nukleotidsequenzen.

Answer

Sie speichert Daten ausschließlich im FASTA-Format.

Answer

Sie konzentriert sich ausschließlich auf menschliche Genomdaten.

Answer

Sie wird vom European Bioinformatics Institute (EBI) gepflegt.

Question 25

Welche der folgenden Dateierweiterungen ist mit FASTA-Dateien verknüpft?

Accepted Answer

.fasta

Answer

.pdb

Answer

.gb

Answer

.xml

Question 26

Welches Format wird vorrangig verwendet, um 3D-Proteinstrukturen zu speichern?

Accepted Answer

PDB

Answer

FASTA

Answer

GenBank

Answer

UniProt

Question 27

Welche Datenbank ist auf die Archivierung von RNA-Sequenzen spezialisiert?

Accepted Answer

RNACentral

Answer

UniProt

Answer

GenBank

Question 28

Welche der folgenden Aussagen ist KEINE zutreffende Beschreibung der Bioinformatik?

Accepted Answer

Sie befasst sich ausschließlich mit der Analyse menschlicher Gene.

Answer

Sie findet Anwendung in verschiedenen Bereichen der Biologie.

Answer

Sie nutzt Computertechnologie zur Verarbeitung biologischer Daten.

Question 29

Welche Datenbank ist die primäre Quelle für öffentlich zugängliche Nukleotidsequenzdaten?

Accepted Answer

GenBank

Answer

KEGG

Answer

UniProt

Answer

PubMed

Question 30

Welches Datenformat wird typischerweise zum Speichern von Proteinsequenzen verwendet?

Accepted Answer

FASTA

Answer

XML

Answer

CSV

Answer

GenBank

Question 31

Welche Datenbank liefert umfassende Informationen über Proteinfunktionen und -strukturen?

Accepted Answer

UniProt

Answer

PubMed

Answer

GenBank

Question 32

Was ist der Zweck einer 'Accession Number' in einer GenBank-Einzeichnung?

Accepted Answer

Eindeutige Identifizierung der Sequenz in der Datenbank

Answer

Beschreibung der Sequenzfunktion

Answer

Angabe der Quelle der Sequenz

Answer

Verweis auf verwandte Sequenzen

Question 33

Wie wird in FASTA-Format die Sequenz eines Proteins von anderen Informationen abgegrenzt?

Accepted Answer

Durch ein '>' Zeichen am Anfang der Sequenzbeschreibung

Answer

Durch ein '|' Zeichen zwischen der Beschreibung und der Sequenz

Answer

Durch Leerzeichen zwischen der Beschreibung und der Sequenz

Question 34

Welches Tool kann verwendet werden, um eine Proteinsequenz in GenBank zu suchen?

Accepted Answer

BLAST

Answer

Clustal Omega

Answer

R

Answer

Python

Question 35

Welche Art von Informationen finden Sie in der 'Feature Table' einer GenBank-Einzeichnung?

Accepted Answer

Genetische Merkmale wie Exons, Introns und Promotoren

Answer

Informationen zur Sequenzquelle

Answer

Proteinsequenzinformationen

Question 36

Welche Datenbank kann verwendet werden, um Informationen über metabolische Pfade und ihre zugehörigen Enzyme zu finden?

Accepted Answer

KEGG

Answer

GenBank

Answer

UniProt

Answer

PubMed

Question 37

Welcher der folgenden Punkte ist ein Vorteil der Verwendung von standardisierten Datenformaten in der Bioinformatik?

Accepted Answer

Erleichterte Datenverarbeitung und -austausch zwischen verschiedenen Programmen und Datenbanken

Answer

Reduzierter Speicherplatzbedarf

Answer

Verbesserte Datenvisualisierung

Question 38

Welche Datenbank bietet Informationen zu wissenschaftlichen Veröffentlichungen im Bereich Biomedizin?

Accepted Answer

PubMed

Answer

KEGG

Answer

GenBank

Answer

UniProt

Question 39

Welches Datenformat wird häufig verwendet, um biologische Sequenzdaten wie DNA-, RNA- oder Proteinsequenzen darzustellen?

Accepted Answer

FASTA

Answer

JSON

Answer

CSV

Answer

XML

Question 40

Welche der folgenden Datenbanken ist eine primäre Quelle für Proteinsequenzdaten?

Accepted Answer

UniProtKB

Answer

EMBL-EBI

Answer

PubMed

Answer

GenBank

Question 41

Was ist ein Vorteil der Verwendung von standardisierten Datenformaten in der Bioinformatik?

Accepted Answer

Ermöglicht den einfachen Datenaustausch und die Analyse zwischen verschiedenen Softwaresystemen.

Answer

Reduziert die Datenqualität.

Answer

Erhöht die Komplexität der Datenanalyse.

Question 42

Sie suchen nach der Aminosäuresequenz eines bestimmten Proteins. Welche Datenbank wäre die geeignetste Quelle?

Accepted Answer

UniProtKB

Answer

KEGG

Answer

GenBank

Answer

PDB

Question 43

Welches Datenformat wird häufig verwendet, um Proteinstrukturen zu speichern und zu visualisieren?

Accepted Answer

PDB

Answer

GenBank

Answer

FASTA

Answer

UniProt

Question 44

Was ist der Zweck der Datenbank „National Center for Biotechnology Information“ (NCBI)?

Accepted Answer

Sammeln, Organisieren und Bereitstellen von biomedizinischen und genomischen Daten.

Answer

Entwicklung von Bioinformatik-Software.

Answer

Durchführung von klinischen Studien.

Question 45

Sie analysieren eine DNA-Sequenz und möchten nach ähnlichen Sequenzen in einer Datenbank suchen. Welches Werkzeug würden Sie verwenden?

Accepted Answer

BLAST

Answer

RasMol

Answer

ClustalW

Question 46

Was ist ein Vorteil der Verwendung von Ontologien in der Bioinformatik?

Accepted Answer

Sie ermöglichen eine standardisierte Beschreibung und Klassifizierung biologischer Daten.

Answer

Sie reduzieren die Datenverfügbarkeit.

Answer

Sie machen die Datenanalyse komplexer.

Question 47

Welche Aussage über GenBank ist richtig?

Accepted Answer

GenBank ist eine annotierte Sammlung öffentlich zugänglicher DNA-Sequenzen.

Answer

GenBank enthält nur Daten von menschlichen Genomen.

Answer

GenBank ist eine kommerzielle Datenbank.

Question 48

Was ist der Unterschied zwischen einer Primär- und einer Sekundärdatenbank in der Bioinformatik?

Accepted Answer

Primärdatenbanken enthalten experimentelle Daten, während Sekundärdatenbanken aus der Analyse von Primärdaten gewonnen werden.

Answer

Primärdatenbanken sind öffentlich, Sekundärdatenbanken sind privat.

Question 49

Welche Datenbank ist die primäre Quelle für Nukleotidsequenzdaten?

Accepted Answer

GenBank

Answer

PDB

Answer

UniProt

Answer

EMBL

Question 50

Welches Datenformat wird typischerweise für die Speicherung von Aminosäuresequenzen verwendet?

Accepted Answer

FASTA

Answer

SAM

Answer

GenBank

Answer

XML

Question 51

Welche Aussage über die Datenbank UniProt ist korrekt?

Accepted Answer

UniProt enthält Informationen zu Proteinsequenzen und -funktionen.

Answer

UniProt ist eine Datenbank für Genexpressionsdaten.

Answer

UniProt speichert ausschließlich DNA-Sequenzen.

Question 52

Welches Format wird verwendet, um die Sekundärstruktur eines Proteins darzustellen?

Accepted Answer

PSSM

Answer

FASTA

Answer

GenBank

Answer

SAM

Question 53

Sie suchen nach Informationen über die 3D-Struktur eines bestimmten Proteins. Welche Datenbank würden Sie konsultieren?

Accepted Answer

PDB

Answer

EMBL

Answer

GenBank

Answer

UniProt

Question 54

Was ist der Hauptzweck des FASTA-Formats?

Accepted Answer

Sequenzinformationen in einem kompakten und lesbaren Format zu speichern

Answer

3D-Proteinstrukturen zu speichern

Answer

Informationen über Genexpressionslevel zu speichern

Question 55

Welche der folgenden Datenbanken ist eine Sammlung von Protein-Protein-Interaktionen?

Accepted Answer

STRING

Answer

GenBank

Answer

UniProt

Answer

PDB

Question 56

Welche Aussage über das GenBank-Format ist korrekt?

Accepted Answer

Es enthält sowohl Sequenzinformationen als auch Metadaten.

Answer

Es ist ein proprietäres Format, das nur von NCBI verwendet wird.

Answer

Es ist ausschließlich für die Speicherung von Aminosäuresequenzen ausgelegt.

Question 57

Welche Datenbank bietet Anmerkungen zu Genomsequenzen, einschließlich Genvorhersagen und funktionalen Informationen?

Accepted Answer

Ensembl

Answer

UniProt

Answer

PDB

Answer

STRING

Question 58

Welche der folgenden Optionen ist KEIN Vorteil der Verwendung von standardisierten Datenformaten in der Bioinformatik?

Accepted Answer

Vereinfachung der Datenanalyse durch proprietäre Formate

Answer

Effiziente Datenübertragung und -speicherung

Answer

Verbesserte Interoperabilität zwischen verschiedenen Tools und Datenbanken